宅基地拆迁补偿归属于村集体所有，宅基地上的房屋拆迁补偿则归属于村民自己所有。农村的宅基地和房屋拆迁是分开补偿。“分开补偿”，是指土地补偿和地上附着物补偿的分离。农村宅基地产权归村集体所有，由村集体分配给村民使用，村民在宅基地上建房子居住。在遇到宅基地拆迁的时候，有两种补偿。一是宅基地补偿，二是房屋补偿。由于宅基地的产权属于村集体，因此，这部分补偿归村集体所有，不会直接给宅基地使用人。而房屋的产权属于村民私有，因此房屋补偿归村民所有。村民的宅基地被征收后，如果没有其他宅基地，那么村集体要给村民重新分配宅基地，让村民在新的宅基地上建房子。
提醒您，农村宅基地房屋的动迁补偿一般分为房屋补偿和宅基地使用权补偿。地上物的补偿，应当归属房屋权利人。房屋原权利人已经死亡的，动迁补偿款可依继承关系进行处理。宅基地使用权补偿款的分割，容易产生争议，特别是非集体经济组织的继承人往往基于继承关系而主张宅基地使用权，进而提出分割相应补偿款。鉴于农村宅基地使用权具有很强的身份属性，系农村集体经济组织无偿提供给本集体成员享有的，并且按户计算。当一户出现人口减少，宅基地仍是由一户中剩余的成员共同使用，宅基地使用权的补偿款则由该户剩余的成员共同所有。若该户已无农村集体经济组织成员，或虽为农村集体经济组织成员，但在他处已取得宅基地使用权的，该宅基地使用权的补偿款一般由该户房屋原权利人的继承人取得，但集体经济组织明确表示反对的除外。
宅基地拆迁引起的纠纷应对方式如下：
1.如果是因土地管理部门审批宅基地，侵犯了利害关系人合法权益的，要注意土地管理部门是否有超越职权、滥用职权、违反法定程序的行为，如果存在这些行为，关系人可以向法院起诉解决。
2.如果是村民争占除宅基地以外的集体空闲地的，看双方是谁先合法占有的，占有时间的长短，地上附属物归哪一方所有，先向当地人民政府申请解决，不服政府处理决定的则可向法院起诉。
3.如果是移位的，看双方对使用面积是否有约定，最好是书面约定，如果是口头约定，看是否有证人证言，对此争议应先向土地管理部门申请解决，不服处理决定的则可向法院起诉。
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