股权转让收入的计算主要依据为转让股权所获得的收入减去为取得该股权所发生的成本。
1.具体来说，当个人或企业进行股权转让时，其所得应等于转让股权的总收入减去取得该股权时所需支付的成本，包括购买股权时的价格、相关税费等。
2.值得注意的是，在计算过程中，企业不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权所可能分配的金额。这样的计算方法旨在确保股权转让所得的准确性和公平性。
提醒您，股权转让收入的确认方法主要有以下几种：
1.净资产核定法：该方法依据每股净资产或股权对应的净资产份额来核定股权的转让收入。
（1）如果被投资企业的特定资产（如土地使用权、房屋等）占企业总资产比例超过20%，主管税务机关可参照具有法定资质的中介机构出具的资产评估报告来核定。
（2）如果在6个月内再次发生股权转让且被投资企业净资产未发生重大变化，主管税务机关可参照上一次股权转让时的资产评估报告来核定。
2.类比法：此方法通过参照相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东、同类行业企业股权的转让收入来核定。这种方法适用于市场上存在类似交易案例的情况。
3.其他合理方法：在以上方法无法适用或存在困难时，主管税务机关可以采取其他合理方法来核定股权转让收入。这些方法需要根据具体情况进行选择和运用。
股权转让收入偏低的情形主要包括以下几种：
1.申报的股权转让收入低于初始投资成本或低于取得该股权所支付的价款及相关税费。这种情况下，股权转让收入明显偏低，可能存在避税或其他不正当目的。
2.申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权的转让收入。这表明股权转让价格可能与市场价值不符，存在不合理性。
3.申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同类行业的企业股权的转让收入。这也表明股权转让价格可能低于行业平均水平，存在不合理的低价转让风险。
4.不具合理性的无偿让渡股权或股份。这种情况下，股权或股份的转让没有产生实际的收入，可能涉及到违法或违规行为。
5.主管税务机关认定的其他情形。这包括但不限于其他可能导致股权转让收入偏低的特殊情况。
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